在Linux下如何批量执行代码
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在Linux下批量执行代码的方法。复杂的可以用snakemake编写定义规则,简单的用shell直接写就可以。
示例代码
想要实现的目标:
1, 有0-9, 10个文件夹
2, 依次进入文件夹, 执行run.sh
脚本, 因为运行时间长, 想用nohup run.sh &
放到后台, 同时保存运行日志nohup.out
1for i in [0-9]*; #1
2 do
3 cd $i; #2
4 nohup run.sh &; #2
5 cd ../;
6done
报错
因为我中间用了&
符号, 提前进入后台, 无法进入下一个循环。
如果不用&
, 那么就是顺序执行,不能批量进行。
1for i in [0-9]*; #1
2 do
3 cd $i; #2
4 nohup run.sh; #2
5 cd ../;
6done
成功代码
1for i in [0-9]*; #1
2 do
3 cd $i; #2
4 echo "nohup run.sh &" | bash; #2
5 cd ../;
6done
这里, nohup一行命令, 先用echo打印, 完整的命令nohup run.sh &
,然后用| bash
执行前面的命令,这样的方式就可以实现我想达到的目的。
写成一行的代码
1for i in [0-9]*; do cd $i; echo "nohup run.sh &" | bash; cd ../;done
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