如何理解R语言中的泊松回归
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当通过一系列连续型和或类别型预测变量的预测计数型结果变量时,泊松回归是非常有用的工具。利用robust包学习和理解泊松回归。
遭受轻微或严重间歇性癫痫的病人的年龄和癫痫发病数收集了数据,包含病人被随机分配到药物组或者安慰剂组前八周和随机 分配后八周内两种情况。响应变量为sumY( 随机后八周内癫痫发病次数),预测变量为治疗条件 (Trt)、年龄(Age)和前八周内的基础癫痫发病次数(Base)。接下来研究药物治疗是否能够减少癫痫发病次数。
> data(breslow.dat,package="robust")
> library(robust)
载入需要的程辑包:fit.models
> names(breslow.dat)
[1] "ID" "Y1" "Y2" "Y3" "Y4" "Base" "Age" "Trt" "Ysum" "sumY" "Age10" #共有12个变量
[12] "Base4"
> summary(breslow.dat[c(6,7,8,10)])#仅描述Base、Age等
Base Age Trt sumY
Min. : 6.00 Min. :18.00 placebo :28 Min. : 0.00
1st Qu.: 12.00 1st Qu.:23.00 progabide:31 1st Qu.: 11.50
Median : 22.00 Median :28.00 Median : 16.00
Mean : 31.22 Mean :28.34 Mean : 33.05
3rd Qu.: 41.00 3rd Qu.:32.00 3rd Qu.: 36.00
Max. :151.00 Max. :42.00 Max. :302.00
> opar <- par(no.readonly = TRUEr)
> par(mfrow=c(1,2))
> attach(breslow.dat)
> hist(sumY,breaks =20,xlab="Seazure Count",main="Distribution of Seizures")
> boxplot(sumY ~ Trt,xlab="Trearment",main="Group Comparisons")
> par(opar)
> fit <- glm(sumY ~ Base + Age + Trt,data = breslow.dat,family = poisson())
> summary(fit)
Call:
glm(formula = sumY ~ Base + Age + Trt, family = poisson(), data = breslow.dat)
Deviance Residuals:
Min 1Q Median 3Q Max
-6.0569 -2.0433 -0.9397 0.7929 11.0061
Coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) 1.9488259 0.1356191 14.370 < 2e-16 ***
Base 0.0226517 0.0005093 44.476 < 2e-16 ***
Age 0.0227401 0.0040240 5.651 1.59e-08 ***
Trtprogabide -0.1527009 0.0478051 -3.194 0.0014 **
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Dispersion parameter for poisson family taken to be 1)
Null deviance: 2122.73 on 58 degrees of freedom
Residual deviance: 559.44 on 55 degrees of freedom
AIC: 850.71
Number of Fisher Scoring iterations: 5
运行过程中产生的图片:
#解释参数:
> coef(fit)
(Intercept) Base Age Trtprogabide
1.94882593 0.02265174 0.02274013 -0.15270095
> exp(coef(fit))
(Intercept) Base Age Trtprogabide
7.0204403 1.0229102 1.0230007 0.8583864
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