ubuntu配置R语言环境-创新互联
ubuntu进不去root，貌似是每次开机时默认root密码都会产生一个新的。
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使用sudo passwrd重置root密码
2. apt-get install r-base
3. apt-get install r-base-dev
4. 安装成功。
5. 安装Rstudio
下载安装包安装
下载 R-3.2.2.tar.gz
解压：
tar
-zvxf
R-2.13.0.tar.gz
配置：
cd
R-2.13.0
./configure
--prefix=/home/xxx/R
--enable-R-shlib
prefix设置R的安装路径，enable-R-shlib可以保证lib目录下的动态库能够共享
如果提示G77错误
sudo
apt-get
install
build-essential
sudo
apt-get
install
gfortran
如果提示错误：configure:error:--with-readline=yes(default)...
sudo
apt-get
install
libreadline6-dev
如果提示错误：configure:error:--with-x=yes(default) and X11...
sudo
apt-get
install
libxt-dev
安装：
make
make
install
link到bin目录下：
cd
/bin
sudo
ln
-sv
/home/xxx/R/bin/R
至此安装完毕。
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安装pkg：
终端下输入：R
source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
默认将安装一下几个包
affy affydata affyPLM
annaffy annotate Biobase
Biostrings DynDoc gcrma
genefilter geneplotter hgu95av2
limma marray matchprobes
multtest ROC vsn
xtable affyQCReport
如果需要Bioconductor上别的包的话，可以使用
biocLite(c("pkg1", "pkg2"))
如：
biocLite(c("copula",
"pspline"))
安装CRAN上的包
install.packages(c("pkg1",
"pkg2"))
来安装（pkg1和pkg2为需要安装的包）。
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编辑器：
1.直接shell。终端输入R，就进入R命令行了。
2.安装GUI：Rcmdr
sudo
apt-get
install
r-cran-rodbc
sudo
apt-get
install
r-cran-rcmdr
运行R后，library(Rcmdr)就可以打开图形界面。
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