Linux文本操作常用命令

在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：

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通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）

接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：

参数的用法介绍：

注意事项：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看

结合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比较少

3.1 less命令

less [参数] 文件名

less命令重要的补充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键

less命令重要的补充用法2 ：

参数用法：

less命令 不加参数 查看文件：

less命令加 -N参数 查看文件：显示行号

less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整

对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好

查看压缩文件

wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。

常见参数:

切记：用less命令，按q退出

cut命令是按关键词来切的

常见参数:

排列前：

排列后：

解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。

uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

换其它文件试试

总之，uniq命令使用时经常和sort一起

常见参数:

常见用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常见用法2 : paste - -

常见参数:

要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容

3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列

4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计

5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符

补充小知识 ：

清屏 ：control L

查看历史（输入过的）命令 ：history

linux常用的命令有哪些

Linux运维人员必会的120个命令

来自《跟老男孩学Linux运维：核心系统命令实战》一书

前言

第1章 Linux命令行简介 / 1

1.1Linux命令行概述 / 1

1.2在Linux命令行下查看命令帮助 / 4

1.3Linux shutdown reboot halt / 9

关机：

shutdown -h now

halt

init 0

第2章 文件和目录操作命令 / 13

2.1pwd：显示当前所在的位置 / 13

2.2cd：切换目录 / 16

2.3tree：以树形结构显示目录下的内容 / 18

2.4mkdir：创建目录 / 22

2.5touch：创建空文件或改变文件的时间戳属性 / 27

2.6ls：显示目录下的内容及相关属性信息 / 30

2.7cp：复制文件或目录 / 39

2.8mv：移动或重命名文件 / 42

2.9rm：删除文件或目录 / 45

2.10rmdir：删除空目录 / 48

2.11ln：硬链接与软链接 / 49

2.12readlink：查看符号链接文件的内容 / 54

2.13find：查找目录下的文件 / 55

2.14xargs：将标准输入转换成命令行参数 / 68

2.15rename：重命名文件 / 71

2.16basename：显示文件名或目录名 / 72

2.17dirname：显示文件或目录路径 / 72

2.18chattr：改变文件的扩展属性 / 73

2.19lsattr：查看文件扩展属性 / 75

2.20file：显示文件的类型 / 76

2.21md5sum：计算和校验文件的MD5值 / 77

2.22chown：改变文件或目录的用户和用户组 / 80

2.23chmod：改变文件或目录权限 / 81

2.24chgrp：更改文件用户组 / 85

2.25umask：显示或设置权限掩码 / 86

2.26老男孩从新手成为技术大牛的心法 / 90

第3章 文件过滤及内容编辑处理命令 / 91

3.1cat：合并文件或查看文件内容 / 91

3.2tac：反向显示文件内容 / 103

3.3more：分页显示文件内容 / 104

3.4less：分页显示文件内容 / 107

3.5head：显示文件内容头部 / 109

3.6tail：显示文件内容尾部 / 111

3.7tailf：跟踪日志文件 / 114

3.8cut：从文本中提取一段文字并输出 / 115

3.9split：分割文件 / 117

3.10paste：合并文件 / 118

3.11sort：文本排序 / 123

3.12join：按两个文件的相同字段合并 / 127

3.13uniq：去除重复行 / 129

3.14wc：统计文件的行数、单词数或字节数 / 131

3.15iconv：转换文件的编码格式 / 133

3.16dos2unix：将DOS格式文件转换成UNIX格式 / 134

3.17diff：比较两个文件的不同 / 135

3.18vimdiff：可视化比较工具 / 138

3.19rev：反向输出文件内容 / 139

3.20tr：替换或删除字符 / 140

3.21od：按不同进制显示文件 / 143

3.22tee：多重定向 / 145

3.23vi/vim：纯文本编辑器 / 147

3.24老男孩逆袭思想：做Linux运维的多个好处 / 152

第4章 文本处理三剑客 / 153

4.1grep：文本过滤工具 / 153

4.2sed：字符流编辑器 / 159

4.3awk基础入门 / 165

第5章 Linux信息显示与搜索文件命令 / 176

5.1uname：显示系统信息 / 176

5.2hostname：显示或设置系统的主机名 / 178

5.3dmesg：系统启动异常诊断 / 179

5.4stat：显示文件或文件系统状态 / 181

5.5du：统计磁盘空间使用情况 / 183

5.6date：显示与设置系统时间 / 186

5.7echo：显示一行文本 / 190

5.8watch：监视命令执行情况 / 193

5.9which：显示命令的全路径 / 195

5.10whereis：显示命令及其相关文件全路径 / 196

5.11locate：快速定位文件路径 / 197

5.12updatedb：更新mlocate数据库 / 199

5.13老男孩逆袭思想：新手在工作中如何问问题不会被鄙视 / 200

第6章 文件备份与压缩命令 / 201

6.1tar：打包备份 / 201

6.2gzip：压缩或解压文件 / 208

6.3zip：打包和压缩文件 / 211

6.4unzip：解压zip文件 / 212

6.5scp：远程文件复制 / 214

6.6rsync：文件同步工具 / 216

6.7老男孩逆袭思想：新手如何高效地提问 / 220

第7章 Linux用户管理及用户信息查询命令 / 222

7.1 useradd：创建用户 / 222

7.2usermod：修改用户信息 / 227

7.3userdel：删除用户 / 229

7.4groupadd：创建新的用户组 / 230

7.5groupdel：删除用户组 / 231

7.6passwd：修改用户密码 / 232

7.7chage:修改用户密码有效期 / 237

7.8chpasswd：批量更新用户密码 / 238

7.9su：切换用户 / 240

7.10visudo：编辑sudoers文件 / 242

7.11sudo：以另一个用户身份执行命令 / 244

7.12id：显示用户与用户组的信息 / 248

7.13w：显示已登录用户信息 / 249

7.14who：显示已登录用户信息 / 250

7.15users：显示已登录用户 / 252

7.16whoami：显示当前登录的用户名 / 253

7.17last：显示用户登录列表 / 253

7.18lastb：显示用户登录失败的记录 / 254

7.19lastlog：显示所有用户的最近登录记录 / 255

第8章 Linux磁盘与文件系统管理命令 / 257

8.1fdisk：磁盘分区工具 / 257

8.2partprobe：更新内核的硬盘分区表信息 / 265

8.3tune2fs：调整ext2/ext3/ext4文件系统参数 / 266

8.4parted：磁盘分区工具 / 268

8.5mkfs：创建Linux文件系统 / 272

8.6dumpe2fs：导出ext2/ext3/ext4文件系统信息 / 274

8.7resize2fs：调整ext2/ext3/ext4文件系统大小 / 275

8.8fsck：检查并修复Linux文件系统 / 278

8.9dd：转换或复制文件 / 281

8.10mount：挂载文件系统 / 284

8.11umount：卸载文件系统 / 288

8.12df：报告文件系统磁盘空间的使用情况 / 289

8.13mkswap：创建交换分区 / 293

8.14swapon：激活交换分区 / 294

8.15swapoff：关闭交换分区 / 295

8.16sync：刷新文件系统缓冲区 / 296

第9章 Linux进程管理命令 / 298

9.1ps：查看进程 / 298

9.2pstree：显示进程状态树 / 305

9.3pgrep：查找匹配条件的进程 / 306

9.4kill：终止进程 / 307

9.5killall：通过进程名终止进程 / 310

9.6pkill：通过进程名终止进程 / 311

9.7top：实时显示系统中各个进程的资源占用状况 / 313

9.8nice：调整程序运行时的优先级 / 320

9.9renice：调整运行中的进程的优先级 / 323

9.10nohup：用户退出系统进程继续工作 / 324

9.11strace：跟踪进程的系统调用 / 325

9.12ltrace：跟踪进程调用库函数 / 332

9.13runlevel：输出当前运行级别 / 334

9.14init：初始化Linux进程 / 335

9.15service：管理系统服务 / 335

第10章 Linux网络管理命令 / 338

10.1ifconfig：配置或显示网络接口信息 / 338

10.2ifup：激活网络接口 / 343

ifup eth0

10.3ifdown：禁用网络接口 / 343

ifdown eth0

service network restart（/etc/init.d/network restart） 激活整个网络，所有网卡。

10.4route：显示或管理路由表 / 344

10.5arp：管理系统的arp缓存 / 350

10.6ip：网络配置工具 / 351

10.7netstat：查看网络状态 / 358

10.8ss：查看网络状态 / 362

10.9ping：测试主机之间网络的连通性 / 363

10.10traceroute：追踪数据传输路由状况 / 366

10.11arping：发送arp请求 / 367

10.12telnet：远程登录主机 / 369

10.13nc：多功能网络工具 / 370

10.14ssh：安全地远程登录主机 / 373

10.15wget：命令行下载工具 / 376

10.16mailq：显示邮件传输队列 / 379

10.17mail：发送和接收邮件 / 381

10.18nslookup：域名查询工具 / 386

10.19dig：域名查询工具 / 389

10.20host：域名查询工具 / 393

10.21nmap：网络探测工具和安全/端口扫描器 / 394

10.22tcpdump：监听网络流量 / 398

第11章 Linux系统管理命令 / 407

11.1lsof：查看进程打开的文件 / 407

11.2uptime：显示系统的运行时间及负载 / 411

11.3free：查看系统内存信息 / 411

11.4iftop：动态显示网络接口流量信息 / 413

11.5vmstat：虚拟内存统计 / 415

11.6mpstat：CPU信息统计 / 419

11.7iostat：I/O信息统计 / 420

11.8iotop：动态显示磁盘I/O统计信息 / 423

11.9sar：收集系统信息 / 425

11.10chkconfig：管理开机服务 / 430

11.11ntsysv：管理开机服务 / 433

11.12 setup：系统管理工具 / 434

11.13ethtool：查询网卡参数 / 436

11.14mii-tool：管理网络接口的状态 / 437

11.19rpm：RPM包管理器 / 443

11.20yum：自动化RPM包管理工具 / 446

top命令

第12章 Linux系统常用内置命令 / 450

12.1Linux内置命令概述 / 450

12.2Linux内置命令简介 / 450

12.3Linux常用内置命令实例 / 452

Linux常用命令

在vim或vi的编辑器中【注： 所有字符均为英文状态下输入】

vim跳转到最后一行

vim跳转至首行

vim显示行号

vim隐藏行号

1、ngg/nG （跳转到文件第n行，无需回车）

2、:n （跳转到文件第n行，需要回车）

3、vim +n filename （在打开文件后，跳转到文件的第n行）

dd：删除游标所在的一整行(常用)

ndd：n为数字。删除光标所在的向下n行，例如20dd则是删除光标所在的向下20行

d1G：删除光标所在到第一行的所有数据

dG：删除光标所在到最后一行的所有数据

d$：删除光标所在处，到该行的最后一个字符

d0：那个是数字0,删除光标所在到该行的最前面的一个字符

x,X：x向后删除一个字符(相当于[del]按键),X向前删除一个字符(相当于[backspace]即退格键)

nx：n为数字，连续向后删除n个字符

Linux常用基本命令（六）

1）service network status 查看指定服务的状态

2）service network stop 停止指定服务

3）service network start 启动指定服务

4）service network restart 重启指定服务

5）service --status-all 查看系统中所有的后台服务

1）chkconfig 查看所有服务器自启配置

2）chkconfig iptables off 关掉指定服务的自动启动

3）chkconfig iptables on 开启指定服务的自动启动

[root@bigdata111 ~]# service crond restart （重新启动服务）

1）基本语法

crontab [选项]

选项：

-e： 编辑crontab定时任务

-l： 查询crontab任务

-r： 删除当前用户所有的crontab任务

2）参数说明

[root@bigdata111 ~]# crontab -e

（1）进入crontab编辑界面。会打开vim编辑你的工作。

* * * * * 执行的任务

（2）特殊符号

（3）特定时间执行命令

3）案例：

*/5 * * * * /bin/echo ”11” /tmp/test

*/1 * * * * /bin/echo ”11” /opt/TZ/ITSTAR

RPM包的名称格式

Apache-1.3.23-11.i386.rpm

- “apache” 软件名称

- “1.3.23-11”软件的版本号，主版本和此版本

- “i386”是软件所运行的硬件平台

- “rpm”文件扩展名，代表RPM包

1）基本语法：

rpm -qa （功能描述：查询所安装的所有rpm软件包）

过滤

rpm -qa | grep rpm软件包

2）案例

[root@bigdata111 Packages]# rpm -qa |grep firefox

firefox-45.0.1-1.el6.centos.x86_64

1）基本语法：

（1）rpm -e RPM软件包

或者（2） rpm -e --nodeps 软件包

--nodeps 如果该RPM包的安装依赖其它包，即使其它包没装，也强迫安装。

2）案例

[root@bigdata111 Packages]# rpm -e firefox

1）基本语法：

rpm -ivh RPM包全名

-i=install，安装

-v=verbose，显示详细信息

-h=hash，进度条

--nodeps，不检测依赖进度

2）案例

[root@bigdata111 Packages]# pwd

/media/CentOS_6.8_Final/Packages

[root@bigdata111 Packages]# rpm -ivh firefox-45.0.1-1.el6.centos.x86_64.rpm

warning: firefox-45.0.1-1.el6.centos.x86_64.rpm: Header V3 RSA/SHA1 Signature, key ID c105b9de: NOKEY

Preparing... ########################################### [100%]

1:firefox ########################################### [100%]

Linux常用命令总结

ps 命令的作用是显示进程信息的；

| 符号，是个管道符号，表示ps 和 grep 命令同时执行；

grep 命令是查找（Global Regular Expression Print），能使用正则表达式搜索文本，然后把匹配的行显示出来；

ps命令有一些参数：

-e : 显示所有进程

-f : 全格式

-h : 不显示标题

-l : 长格式

-w : 宽输出

a ：显示终端上的所有进程，包括其他用户的进程。

r ：只显示正在运行的进程。

u ：以用户为主的格式来显示程序状况。

x ：显示所有程序，不以终端机来区分。

结果信息从前到后依次是：

UID PID PPID C STIME TTY TIME CMD

zzw 14124 13991 0 00:38 pts/0 00:00:00 grep –color=auto dae

Linux中的top命令显示系统上正在运行的进程。它是系统管理员最重要的工具之一。被广泛用于监视服务器的负载。top命令是一个交互命令。在运行top的时候还可以运行很多命令。

N – 以 PID 的大小的顺序排列表示进程列表

P – 以 CPU 占用率大小的顺序排列进程列表

M – 以内存占用率大小的顺序排列进程列表

q – 退出 top

h – 帮助

1 系统运行时间和平均负载

这些字段显示：当前时间、系统已运行的时间、当前登录用户的数量、相应最近5、10和15分钟内的平均负载。

2 任务

第二行显示的是任务或者进程的总结。进程可以处于不同的状态。这里显示了全部进程的数量。除此之外，还有正在运行、睡眠、停止、僵尸进程的数量（僵尸是一种进程的状态）。这些进程概括信息可以用’t’切换显示。

3 CPU 状态

下一行显示的是CPU状态。 这里显示了不同模式下的所占CPU时间的百分比。这些不同的CPU时间表示:

us, user： 运行(未调整优先级的) 用户进程的CPU时间

sy，system: 运行内核进程的CPU时间

ni，niced：运行已调整优先级的用户进程的CPU时间

wa，IO wait: 用于等待IO完成的CPU时间

hi：处理硬件中断的CPU时间

si: 处理软件中断的CPU时间

st：这个虚拟机被hypervisor偷去的CPU时间（译注：如果当前处于一个hypervisor下的vm，实际上hypervisor也是要消耗一部分CPU处理时间的）。

4 内存使用

接下来两行显示内存使用率，有点像’free’命令。第一行是物理内存使用，第二行是虚拟内存使用(交换空间)。

物理内存显示如下:全部可用内存、已使用内存、空闲内存、缓冲内存。相似地：交换部分显示的是：全部、已使用、空闲和缓冲交换空间。

5 各列的意思

PID 进程ID，进程的唯一标识符

USER 进程所有者的实际用户名。

PR 进程的调度优先级。这个字段的一些值是’rt’。这意味这这些进程运行在实时态。

NI 进程的nice值（优先级）。越小的值意味着越高的优先级。

VIRT 进程使用的虚拟内存。

RES 驻留内存大小。驻留内存是任务使用的非交换物理内存大小。

SHR SHR是进程使用的共享内存。

S 这个是进程的状态。它有以下不同的值:

D – 不可中断的睡眠态。

R – 运行态

S – 睡眠态

T – 被跟踪或已停止

Z – 僵尸态

%CPU 自从上一次更新时到现在任务所使用的CPU时间百分比。

%MEM 进程使用的可用物理内存百分比。

TIME+ 任务启动后到现在所使用的全部CPU时间，精确到百分之一秒。

COMMAND 运行进程所使用的命令。

注意 ：不同发行版的top命令在各种细节有不同，如果发现不同时，请读你的帮助手册和命令内的帮助。）

kill、kill-15、kill-9区别:

执行kill（默认kill -15）命令，系统会发送一个SIGTERM信号给对应的程序,大部分程序接收到SIGTERM信号后，会先释放自己的资源，然后再停止。用法kill pid。

kill -15 pid。

kill -9命令，系统给对应程序发送的信号是SIGKILL，即exit。exit信号不会被系统阻塞，所以kill -9能顺利杀掉进程。用法kill -9 pid。

tail -n 1000：显示最后1000行

tail -n +1000：从1000行开始显示，显示1000行以后的

head -n 1000：显示前面1000行

cat a.txt 显示文件

vim xx.conf 编辑文件

打开文件后，按insert键进入编辑模式；编辑完后，按esc建退出编辑模式；按shift+冒号后，输入wq保存退出，wq!保存强制退出，q不保存退出

在根目录模糊查找名字含java的文件

服务器端常有很多压缩过的日志文件，当需要查找日志中某些特定信息的时候，为了避免解压文件，可以使用zgrep，zcat等命令查找、查看压缩文件中的信息

zgrep ' 输入你要查找的东东' /目录 /文件 .gz 或者.log （当日）

grep ' 输入你要查找的东东' /目录 /文件 .gz 或者.log （非当日的压缩文件）

例如： zgrep 'callMktCamLoad' app.log.2019-12-03-*.gz

rpm包安装的，可以用 rpm -qa 看到，如果要查找某软件包是否安装，用 rpm -qa | grep "软件或者包的名字"

以deb包安装的，可以用 dpkg -l 看到。如果是查找指定软件包，用 dpkg -l | grep "软件或者包的名字"

yum方法安装的，可以用 yum list installed 查找，如果是查找指定包，用 yum list installed | grep "软件名或者包名"

linux常用命令

linux常用命令如下：

1、查看内核版本：uname -a。

2、控制台-图形界面：init 5或者startx。

3、图形界面-控制台: init3或者直接注销。

4、如何查看ip地址：ifconfig。

5、配置ip:ifconfig eth0 ip地址。

6、重启：reboot 或者 shutdown -r now。

操作命令

首先介绍一个名词“控制台”，它就是我们通常见到的使用字符操作界面的人机接口，例如dos。我们说控制台命令，就是指通过字符界面输入的可以操作系统的命令，例如dos命令就是控制台命令。我们要了解的是基于Linux操作系统的基本控制台命令和dos命令不同的是，Linux的命令（也包括文件名等等）对大小写是敏感的。

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