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【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题

最近有粉丝反映说，利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候，发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图柱形图这个图别说美观了，简直不忍直视。经过我的认真研究，发现跟R版本有关。

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但是该方法存在一个很大的问题，那就是当x轴标签数量很多时，那么就无法通过这样的方法进行解决了。方法二是方法一的逆向思路，既然可以调大画布，那么反过来，我们也可以调小x轴标签字体。

最近小Q在做自然选择分析，分析完之后简单粗暴的对候选基因做了富集分析，并做了展示，比起气泡图，我模仿了另一种作图方式，显示效果更佳。所以想在此分享一下如何用R语言画富集分析示意图（非气泡图）。

在是否需要构建的问题上，我看到徐洲更在功能注释后如何做富集分析中提到 “你不需要构建Orgdb，因为Orgdb的用途是进行基因编号和GO/KEGG的转换。

单细胞富集分析我最常用的是分组GSVA ，但最近用到了GO分析，就复习一下GO和KEGG富集分析及绘图。载入无比熟悉的pbmc.3k数据集 (已注释好，数据准备见 monocle )pbmc3k数据集只有1个样本，没办法区分HC和病例组。

1、(注：你系统内的汇编程序为MASM.EXE，如果你系统的汇编程序为ASM.EXE时，便将命令变为ASM filename回车。

2、一般汇编语言是在masm下编辑的，生成exe执行文件，没什么很高要求。

3、不需要特别的软件环境，只需要手头有一个汇编语言编译器和一个文本编辑器就够了。文本编辑器推荐使用masm， editplus之类的，可以高亮代码中的关键字，当然如果你愿意用记事本也行。

4、可以搜下集成汇编环境啊，像“轻松汇编”，辰灿汇编语言集成开发环境， MasmEditor这些。集成环境里面汇编调试这些都比较方便。下面这个操作非常简单。

一个工程就是就是一个C程序，工程虽然可以包含多个程序文件，但不可以编译多个C程序。编译器是在编译阶段分别编译工程内的多个文件，最后将编译各个文件得到的多个obj目标文件链接到一起成为一个可执行程序。

name ：要打开的文件名 flag ：打开文件的模式。模式有以下几种：perm ：文件权限，一个八进制数。r（读）04，w（写）02，x（执行）01。

Go 命令在go.work文件指定的hello目录中查找命令行中指定的example点抗 /hello模块，同样使用go.work文件解析导入golang.org/x/example。go.work可以用来代替添加replace 指令以跨多个模块工作。

下载并安装goclipse插件。Goclipse是go语言for eclipse的插件，下载地址：http：//code.google点抗 /p/goclipse/ 启动eclipse并创建go项目。然后写个最简单的helloworld.go文件，并运行。

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